人工湿地系统达到最优净化处理效率需2-3个生长周期，运用人工湿地技术模拟自然水景生态系统，能够过滤悬浮物和吸收氮磷，可使水体一段时间内保持清澈和无异味的状态。

但在实际应用中，人工湿地系统尚有不少不足的地方，主要有以下几个方面：

（1）土地问题

据经验表明，人工湿地处理1m³生活污水需要占地5-10m²。即使是水污染程度较低的景观水净化处理，土地实际需要量仍然很大。

（2）净化问题

人工湿地技术难以去除污水中的氯化物、高浓度氮氨、色度等。

（3）水体问题

水量3000m³-5000m³的水系比较适合运用人工湿地净化技术，超此范围内的水体（该项目水量为20多万m³）因循环时间过长及水泵调水成本过大，需结合实际项目具体分析。

（4）池底结构问题

人工湿地应如何处理池底防漏及与地下水双向流动的问题。

（5）堵塞问题

据美国环保局对100多个运行中人工湿地的调查，有将近一半的湿地系统在投入使用后的5年内出现了堵塞问题，其水力传导系数降低，除污效果变差，运行寿命缩短。